Reformater le tout.
Relancer l'install par le CD, il s'occupe du reste!
Si ça ne fonctionne pas, passer par les disquettes d'install (win95, win98: préparation du DD)
Autre solution: recréer la ou les partition(s) en manuel, puis lancer l'install
Si ça bug toujours, il y a des utilitaires permettant de vérifier les DD en cas de dégâts physiques éventuels, ces derniers seront isolés et l'install reprendra normalement